Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK8P49336 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK8P49336 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK8P49336 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK8P49336 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK8P49336 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK8P49336 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK8P49336 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK8P49336 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms