Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI2P48788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI2P48788 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms