Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6CP48668 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6CP48668 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms