Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC1A6P48664 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC1A6P48664 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms