Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ1P48048 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms