Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms