Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTRNP46939 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UTRNP46939 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UTRNP46939 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UTRNP46939 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UTRNP46939 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
UTRNP46939 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UTRNP46939 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTRNP46939 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTRNP46939 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTRNP46939 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTRNP46939 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UTRNP46939 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UTRNP46939 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTRNP46939 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UTRNP46939 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UTRNP46939 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms