Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT3P45378 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT3P45378 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms