Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms