Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HADHAP40939 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HADHAP40939 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HADHAP40939 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHAP40939 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHAP40939 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHAP40939 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHAP40939 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms