Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC26A3P40879 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC26A3P40879 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC26A3P40879 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC26A3P40879 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC26A3P40879 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms