Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THPOP40225 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THPOP40225 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THPOP40225 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THPOP40225 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THPOP40225 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THPOP40225 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THPOP40225 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THPOP40225 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THPOP40225 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THPOP40225 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THPOP40225 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THPOP40225 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THPOP40225 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms