Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPGP40121 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPGP40121 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPGP40121 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPGP40121 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPGP40121 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPGP40121 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPGP40121 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPGP40121 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms