Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGP37231 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPARGP37231 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGP37231 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGP37231 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARGP37231 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms