Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF1P36956 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms