Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA7P36544 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNA7P36544 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms