Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA4P35212 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA4P35212 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA4P35212 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA4P35212 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA4P35212 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA4P35212 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA4P35212 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA4P35212 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA4P35212 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA4P35212 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA4P35212 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms