Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPOP30536 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPOP30536 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPOP30536 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPOP30536 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms