Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP1P29466 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP1P29466 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP1P29466 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP1P29466 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP1P29466 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP1P29466 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP1P29466 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP1P29466 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP1P29466 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP1P29466 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP1P29466 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP1P29466 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP1P29466 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP1P29466 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP1P29466 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP1P29466 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP1P29466 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP1P29466 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms