Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID4AP29374 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID4AP29374 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms