Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD34P28906 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD34P28906 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD34P28906 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD34P28906 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD34P28906 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD34P28906 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD34P28906 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms