Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VARSP26640 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VARSP26640 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VARSP26640 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VARSP26640 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VARSP26640 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VARSP26640 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms