Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms