Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNCP24863 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNCP24863 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNCP24863 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNCP24863 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNCP24863 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms