Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GADD45AP24522 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GADD45AP24522 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GADD45AP24522 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GADD45AP24522 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GADD45AP24522 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms