Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCP2P22307 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2P22307 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2P22307 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2P22307 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2P22307 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCP2P22307 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCP2P22307 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCP2P22307 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCP2P22307 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCP2P22307 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCP2P22307 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCP2P22307 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCP2P22307 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCP2P22307 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCP2P22307 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms