Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSRP1P21291 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSRP1P21291 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSRP1P21291 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSRP1P21291 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSRP1P21291 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSRP1P21291 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSRP1P21291 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSRP1P21291 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP1P21291 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms