Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK11BP21127 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK11BP21127 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms