Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDCP19113 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDCP19113 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDCP19113 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDCP19113 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDCP19113 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDCP19113 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDCP19113 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms