Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH2P19022 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH2P19022 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH2P19022 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH2P19022 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH2P19022 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH2P19022 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms