Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms