Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOT1P17174 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOT1P17174 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOT1P17174 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOT1P17174 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOT1P17174 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOT1P17174 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOT1P17174 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOT1P17174 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms