Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms