Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF4P15884 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF4P15884 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF4P15884 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF4P15884 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms