Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VEGFAP15692 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms