Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UCHL3P15374 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UCHL3P15374 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms