Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms