Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A1P13866 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A1P13866 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A1P13866 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms