Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG2P13521 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG2P13521 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG2P13521 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG2P13521 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG2P13521 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG2P13521 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG2P13521 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG2P13521 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG2P13521 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG2P13521 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG2P13521 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG2P13521 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG2P13521 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms