Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRCP12931 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRCP12931 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRCP12931 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRCP12931 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRCP12931 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRCP12931 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRCP12931 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRCP12931 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCP12931 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCP12931 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCP12931 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRCP12931 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCP12931 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms