Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms