Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK4P11802 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK4P11802 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK4P11802 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK4P11802 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK4P11802 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK4P11802 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK4P11802 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK4P11802 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms