Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms