Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms