Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2BP0DI82 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2BP0DI82 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms