Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA6AP0CW24 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA6AP0CW24 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms