Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRCP08575 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCP08575 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms