Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM2P07951 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM2P07951 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM2P07951 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM2P07951 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM2P07951 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms