Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPBP07199 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPBP07199 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPBP07199 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPBP07199 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPBP07199 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPBP07199 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPBP07199 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPBP07199 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPBP07199 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPBP07199 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPBP07199 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPBP07199 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPBP07199 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPBP07199 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPBP07199 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPBP07199 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPBP07199 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPBP07199 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPBP07199 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPBP07199 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPBP07199 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPBP07199 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPBP07199 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPBP07199 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPBP07199 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms