Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DQB2P05538 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB2P05538 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms